新的演算法讓炙手可熱的CRISPR變得更簡單

jiunn36

　　近幾年來，可以用來精準的操控任何生物DNA的CRISPR技術受到生物科技展業的大量關注。雖然好用，但是科學家仍然需要一些軟體的演算來加速這個過程。
　　CRISPR又稱常間回文重複序列叢集(Clustered Regularly-Interspaced Short Palindromic Repeats)，原本是一個細菌用以抵抗病毒入侵的機制，科學家利用這個現象來關掉某個基因或是在準確的位置插入DNA。這個系統有兩個重要的核心：一小段可以調整的基因序列(又稱引導 RNA)還有一個做為基因「剪刀」的蛋白質(通常是一個叫做Cas9的DNA酵素)。引導RNA帶著Cas9在生物體的基因體中尋找可以配對的DNA序列，像魔鬼氈一樣黏住然後讓Cas9去切斷DNA。這些序列由 4個鹼基(base)組成，分別是：腺嘌呤(A，Adenine)、胸腺嘧啶(T，Thymine)、鳥糞嘌呤(G，Guanine)與胞嘧啶(C，Cytosine)。細胞內的修復機制接著把斷口接起來，並在過程中破壞或夾進一些DNA序列，以此擾亂基因。生物學家們也可以在指定位置加入想要的鹼基對。
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